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xampp下:通过SQLMAP上传shell

XAMPP下载 中文小张 86浏览 0评论

JBrowse,可以把它理解为一个网站(网页),只不过使用它不再需要从 HTML 和 CSS 写起,也不用 JS 来编写各种 function。其次它的功能是用来展示各种基因信息,比如基因的外显子、内含子,比如转座子和重复序列或者SNP等。

优点:

  • 数据呈现的压力从本机转移到了后端服务器。
  • 其本身的网站属性让你我都可以随时访问。
  • 安装
  • 首先下载JBrowse安装包
  • 接下来。。。嗯。。。手动安装JBrowse实在很折磨。。花了三天也没整好,不知道是我模块安装不全还是哪里的配置没设好。。
    总之,最后放弃了,惭愧惭愧 还是 经验太少能力太弱。
    然后尝试用 bioconda 安装Jbrowse。 试了之后,真香!
  • 用 bioconda 安装Jbrowse
  • 一、先上conda的网站,查询是否含有我们所需的包https://anaconda.org/search?q=JBrowse+&sort=ndownloads&sort_order=-1&reverse=false
  • 三、安装好了之后,cd 到 conda 安装的路径
  • 四、将整个Jbrowse文件夹cp到 /opt/lampp/htdocs/
  • 因为我用的是xampp,所以cp到该文件夹下就可以直接在网上浏览了。那么如果你使用的是其他的
    web服务器软件,如 nginx ,将Jbrowse拷贝到相应的文件夹下即可。
  • 五、用浏览器访问 index.html ,查看JBrowse是否可以正常运行。浏览器访问: 你的IP/jbrowse-1.16.2-pl526h6bb024c_7/opt/jbrowse/index.html
  • 六、运行 setup.sh ,安装一些模块之类的,还会配置一个示例data用于展示。(注意:官网有强调,不能用root安装)
  • ./setup.sh

    嗯。。这个脚本跑了很久一直跑不成功。。。在 setup.log 文件中,可以查看一些报错信息,然后去解决。

    我运行的时候,示例数据一直处理不成功,不知道为何 , 但是不影响,做自己的数据没问题。

  • 配置
  • 一、配置参考基因组使用 prepare-refseqs.pl 脚本
    bin/prepare-refseqs.pl --fasta 参考基因组文件

    配置完之后,会在当前文件夹下产生一个 data 文件夹,里面含有一些配置信息。
    参考序列生成的 track 会为后续所有文件提供一个坐标,一直放大后参考序列的碱基也会显示出来。

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